RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FCHO1	O14526	889 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ADAM12	O43184	909 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	VHL	P40337	213 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MIB1	Q86YT6	1006 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CNTD1	Q8N815	330 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	GIPC2	Q8TF65	315 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MAFK	O60675	156 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT37	O76014	449 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ALDH1A2	O94788	518 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	EFEMP2	O95967	443 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PGAM1	P18669	254 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	USP41	Q3LFD5	358 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	NAT9	Q9BTE0	207 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CWH43	Q9H720	699 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	15.97	■□□□□ 0.15	8e-6	■□□□□ 9.8
GRSF1-208	ENST00000545193	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TBX21	Q9UL17	535 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	NUP205	Q92621	2012 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM24	O75264	130 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMG1	O95456	288 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	KIT	P10721	976 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINB4	P48594	390 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	NEK3	P51956	506 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMD5	Q16401	504 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	LGSN	Q5TDP6	509 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF220	Q5VTB9	566 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	USP33	Q8TEY7	942 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	VWCE	Q96DN2	955 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	APOPT1	Q96IL0	206 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	COMMD8	Q9NX08	183 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MTRR	Q9UBK8	725 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ATF6	P18850	670 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	AFMID	Q63HM1	303 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	STMN2	Q93045	179 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM136A	Q96C01	138 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	WASH4P	A8MWX3	477 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR1D2	P34982	312 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC18A2	Q05940	514 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PHC3	Q8NDX5	983 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	IGSF21	Q96ID5	467 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CASS4	Q9NQ75	786 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	UBP1	Q9NZI7	540 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193		B2RBV5	119 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	MATN3	O15232	486 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PGM1	P36871	562 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC34A1	Q06495	639 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	BMPR2	Q13873	1038 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	TREML1	Q86YW5	311 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM161B	Q96MY7	647 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		15.95	■□□□□ 0.14

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