RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ENPEP	Q07075	957 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	NNT	Q13423	1086 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	NR0B2	Q15466	257 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TAF5	Q15542	800 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CNGA2	Q16280	664 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL22	Q6P050	247 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	C14orf80	Q86SX3	495 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PSMB7	Q99436	277 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	EPN3	Q9H201	632 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PQM1	296 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ETV5	P41161	510 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ARSI	Q5FYB1	569 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PARG	Q86W56	976 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	VOPP1	Q96AW1	172 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CREBBP	Q92793	2442 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557		F5H5T6	163 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557		M0QYV0	167 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TPP1	O14773	563 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	YY2	O15391	372 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ITIH1	P19827	911 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	RRM1	P23921	792 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CCL7	P80098	99 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXK1	P85037	733 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ARTN	Q5T4W7	220 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM270	Q6UE05	265 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	JAML	Q86YT9	394 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TMIE	Q8NEW7	156 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	HSFY1	Q96LI6	401 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC61	Q9BV99	259 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	GGT7	Q9UJ14	662 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	IGLON5	A6NGN9	336 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CNTN5	O94779	1100 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ENDOD1	O94919	500 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO21	O94952	628 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	GPD2	P43304	727 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PFN3	P60673	137 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SPIDR	Q14159	915 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	DTX1	Q86Y01	620 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	IL12RB2	Q99665	862 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	HDAC8	Q9BY41	377 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PISD	Q9UG56	409 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	LMO7DN	F2Z398	122 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557		I6L893	689 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42

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