RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	TGFB3	P10600	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ADD2	P35612	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CDH12	P55289	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ZP1	P60852	638 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TAF5	Q15542	800 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344		Q6ZSV7	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MED30	Q96HR3	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LHPP	Q9H008	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	EVPL	Q92817	2033 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MST1R	Q04912	1400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	STX16	O14662	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MCM2	P49736	904 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MVD	P53602	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ABAT	P80404	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LTB	Q06643	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PKP1	Q13835	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	NCSTN	Q92542	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DERA	Q9Y315	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	VWA5A	O00534	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	HBP1	O60381	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	NBN	O60934	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PEX14	O75381	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM155B	O75949	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	METTL18	O95568	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	IL1A	P01583	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DPP6	P42658	865 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ACTR2	P61160	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	WASF1	Q92558	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344		B9A039	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	EYA2	O00167	538 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LDB2	O43679	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CLDN7	O95471	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TK1	P04183	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PRSS2	P07478	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CD72	P21854	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	THPO	P40225	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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