RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF17O60258 216 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPP40O75818 363 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMCC1O94876 653 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CH25HO95992 272 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VIPP01282 170 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HRGP04196 525 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYZAPP0CAP1 466 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPH2P23942 346 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP4A11Q02928 519 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF543Q08ER8 600 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA5AQ13591 1074 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DAG1Q14118 895 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRM3Q14832 879 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFHC1Q5JVL4 640 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERAP2Q6P179 960 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC26A9Q7LBE3 791 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9B2Q86UD5 537 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFN1Q86VF2 1251 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM185AQ8N0U4 392 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP11CQ8NB49 1132 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEPTORQ8TB45 409 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2CD4CQ8TF44 421 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPT1BQ92523 772 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF524Q96C55 264 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPATCH3Q96I76 525 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAR2Q96K12 515 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F2RL3Q96RI0 385 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSF3RQ99062 836 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTBD1Q9H0C5 482 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSTL1Q9H114 145 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOX4Q9NPH5 578 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGL1Q9NZL6 768 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZIM2Q9NZV7 527 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAK5Q9P286 719 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO1AQ9UBC5 1043 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC12A4Q9UP95 1085 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DTNAQ9Y4J8 743 aa1.01□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GVM2 712 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM234BA2RU67 622 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPED1A4D0V7 1026 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHPN2P1A8MT19 583 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF28PB7ZC32 967 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM72CH0Y354 149 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF3BO15066 747 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN14O95500 239 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDAH2O95865 285 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBED1O96006 694 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRGAP2BP0DMP2 458 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CKMT1AP12532 417 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRCP12931 536 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYL1P12980 280 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRG2P13727 222 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLA-DOBP13765 273 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC5A1P13866 664 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKCHP24723 683 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLRK1P26718 216 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FMO4P31512 558 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP2J2P51589 502 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNB3P54284 484 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADORA2A-AS1P86434 159 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMP22Q01453 160 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA0753Q2KHM9 967 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM72AQ5TYM5 149 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM171A1Q5VUB5 890 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM72DQ6L9T8 149 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC149Q6ZUS6 474 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERPINA11Q86U17 422 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRABD2AQ86V40 505 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM72BQ86X60 149 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBFAQ8N0V3 343 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYG1Q8N1E2 194 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AADATQ8N5Z0 425 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HDAC7Q8WUI4 952 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMM1Q92871 262 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHKBQ93100 1093 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LGALS12Q96DT0 336 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FEM1CQ96JP0 617 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC14Q96N46 770 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGEB5Q9BZ81 275 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPS8L2Q9H6S3 715 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A11Q9NSA0 550 aa1□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf112Q9NSG2 853 aa1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms