RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCN6P51797 869 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TPI1P60174 286 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 PPM1JQ5JR12 505 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6K2Q8NGY2 324 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 OR14C36Q8NHC7 312 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 HMCESQ96FZ2 354 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP85Q9BW27 656 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TM6SF2Q9BZW4 377 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 PCED1AQ9H1Q7 454 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SUSD2Q9UGT4 822 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 WASF2Q9Y6W5 498 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 KNL1Q8NG31 2342 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SPEGQ15772 3267 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP33O14559 1287 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MFAP3LO75121 409 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GKP32189 559 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNA3P32297 505 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RETSATQ6NUM9 610 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS36Q86VN1 386 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 VOPP1Q96AW1 172 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A18Q96N87 628 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TM9SF3Q9HD45 589 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GVT2 93 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT9AO14904 365 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GIPC1O14908 333 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP1A2P05177 515 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GNSP15586 552 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DESP17661 470 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R38P59533 333 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM14Q14142 442 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNT1Q5JUK3 1230 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC122Q5T0U0 273 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DSG4Q86SJ6 1040 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF354CQ86Y25 554 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 NPWQ8N729 165 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T34Q8NGX1 318 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEH1Q9H213 219 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 IL21RQ9HBE5 538 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ANAPC7Q9UJX3 599 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 WASH4PA8MWX3 477 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RASA4BC9J798 803 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RASA4O43374 803 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPSAP2O60256 369 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LEFTY1O75610 366 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF8O76064 485 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CD27P26842 260 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DNA2P51530 1060 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RFX8Q6ZV50 586 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP44Q9C0F1 390 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ZWILCHQ9H900 591 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 IL36AQ9UHA7 158 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC72A6NJI9 287 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PCNX2A6NKB5 2137 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 KDELR3O43731 214 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GJB3O75712 270 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TMCC1O94876 653 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ETFBP38117 255 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSIQ5FYB1 569 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM46CQ5VWP2 391 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TP53INP2Q8IXH6 220 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC114Q96M63 670 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CHP1Q99653 195 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RETREG1Q9H6L5 497 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC19Q9H756 370 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms