RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PLK2Q9NYY3 685 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SELENONQ9NZV5 590 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 LRFN1Q9P244 771 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 METP08581 1390 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NEURL1O76050 574 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TNFRSF6BO95407 300 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FGF2P09038 288 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 GSTM2P28161 218 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SERPINA4P29622 427 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MLH1P40692 756 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RASSF2P50749 326 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ERV3-1Q14264 604 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 AAGABQ6PD74 315 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CCDC25Q86WR0 208 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PELI3Q8N2H9 469 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 C3orf49Q96BT1 292 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ZPBPQ9BS86 351 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ISCUQ9H1K1 167 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ARL15Q9NXU5 204 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 DACT1Q9NYF0 836 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ZNF580Q9UK33 172 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 AFF2P51816 1311 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TECPR2O15040 1411 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CYP1A2P05177 515 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RFX2P48378 723 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MCM2P49736 904 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 BLMHQ13867 455 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM171A1Q5VUB5 890 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KAT2AQ92830 837 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ZNF333Q96JL9 665 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RMDN3Q96TC7 470 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 IFT27Q9BW83 186 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 WNT16Q9UBV4 365 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PKP3Q9Y446 797 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KIF1AQ12756 1690 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 AGAP5A6NIR3 686 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SEPT4O43236 478 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 HOXB2P14652 356 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CPA1P15085 419 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KLRC2P26717 231 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SERPINF1P36955 418 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 C5orf22Q49AR2 442 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 EXD3Q8N9H8 876 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 BICD2Q8TD16 824 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 IP6K1Q92551 441 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms