RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 IL9P15248 144 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 IVDP26440 423 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 FDFT1P37268 417 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CUL1Q13616 776 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PARP6Q2NL67 630 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PCGF5Q86SE9 256 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CNTD1Q8N815 330 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SEC14L1Q92503 715 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 WHRNQ9P202 907 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SEPT3Q9UH03 358 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 NDC80O14777 642 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 METTL18O95568 372 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 HLA-DQB2P05538 268 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CISD3P0C7P0 127 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PSMB4P28070 264 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 LMAN1P49257 510 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PLTPP55058 493 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 VSNL1P62760 191 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 KDSRQ06136 332 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SULT2A1Q06520 285 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GEN1Q17RS7 908 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GAB4Q2WGN9 574 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 MBLAC2Q68D91 279 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TEX26Q8N6G2 289 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CIPCQ9C0C6 399 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ASGR2P07307 311 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 NFKB1P19838 968 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ITGA8P53708 1063 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PRPSAP1Q14558 356 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 WDR93Q6P2C0 686 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GBA3Q9H227 469 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GLOD4Q9HC38 313 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.43■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ARNTLO00327 626 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 MAXP61244 160 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ECT2LQ008S8 904 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SLC20A2Q08357 652 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 NFU1Q9UMS0 254 aa22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TMCC1O94876 653 aa22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 MT-CO1P00395 513 aa22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 APRTP07741 180 aa22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.41■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 OPRD1P41143 372 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CAV1Q03135 178 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CYTH1Q15438 398 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CPT1BQ92523 772 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 K7ERQ8 282 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 CD160O95971 181 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 NNMTP40261 264 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SOX9P48436 509 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 MORF4L2Q15014 288 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ACCSLQ4AC99 568 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM215Q68D42 235 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ART4Q93070 314 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 EXOC4Q96A65 974 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 PSKH2Q96QS6 385 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.4■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 UBP1Q9NZI7 540 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms