RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 TLDC2A0PJX2 215 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 RASGRF2O14827 1237 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 IVLP07476 585 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 SSTR1P30872 391 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 GPX6P59796 221 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 ITKQ08881 620 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 SIGLEC10Q96LC7 697 aa27.28■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 DNAAF3Q8N9W5 541 aa27.27■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 CFAP36Q96G28 342 aa27.26■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 CASS4Q9NQ75 786 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 CDH23Q9H251 3354 aa27.26■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 SLCO1A2P46721 670 aa27.25■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.25■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 FSHRP23945 695 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 MPP3Q13368 585 aa27.24■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 WFDC5Q8TCV5 224 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 TBL1YQ9BQ87 522 aa27.24■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 APOL5Q9BWW9 433 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 FSD1LQ9BXM9 530 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 VPS45Q9NRW7 570 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
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HOXB3-210ENST00000489475 AGBL2Q5U5Z8 902 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 GPR149Q86SP6 731 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 CCNJLQ8IV13 435 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 FIBINQ8TAL6 211 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 FBF1Q8TES7 1133 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 OTUB2Q96DC9 234 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 PGM2Q96G03 612 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 NAT9Q9BTE0 207 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 VPS18Q9P253 973 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB3-210ENST00000489475 RABGEF1Q9UJ41 708 aa27.23■■□□□ 1.95
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