RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489095.1

TRBV5-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV5-2, Length 273 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-2-201ENST00000489095 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 OSER1Q9NX31 292 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GMIPQ9P107 970 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 COPG2Q9UBF2 871 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HAO1Q9UJM8 370 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TLK1Q9UKI8 766 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 EMCNQ9ULC0 261 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 A0A087X1B8 175 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 A0A096LPK6 155 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MTMR11A4FU01 709 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ATP9BO43861 1147 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 B4GALT3O60512 393 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 KLHL2O95198 593 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ALDH2P05091 517 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HLA-DQB2P05538 268 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SERPINA6P08185 405 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 T-ENOLP0DO92 83 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 RALBP11234 206 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CPB1P15086 417 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SERPINB3P29508 390 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SERPINB5P36952 375 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC1A6P48664 564 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CSRP3P50461 194 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 AQP5P55064 265 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IL10RBQ08334 325 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC12A1Q13621 1099 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ARTNQ5T4W7 220 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MARC1Q5VT66 337 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FUT10Q6P4F1 479 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 LRRC43Q8N309 656 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NETO2Q8NC67 525 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IPMKQ8NFU5 416 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PEX13Q92968 403 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 FICDQ9BVA6 458 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SP110Q9HB58 689 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TREX1Q9NSU2 369 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 MRGBPQ9NV56 204 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 TTC3P53804 2025 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 DRGXA6NNA5 263 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 CAPN14A8MX76 684 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 F8W810 466 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 ENPP3O14638 875 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC22A2O15244 555 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV5-2-201ENST00000489095 GYG2O15488 501 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms