RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	TIMP4	Q99727	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	KDM5C	P41229	1560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	RNF8	O76064	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	LYL1	P12980	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TACR3	P29371	465 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	AVPR2	P30518	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TDG	Q13569	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	PDILT	Q8N807	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	UROC1	Q96N76	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	PER2	O15055	1255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	FIBP	O43427	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	TIMM44	O43615	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	GFPT2	O94808	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CLEC3B	P05452	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ACADM	P11310	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ALOX12	P18054	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	GPD1	P21695	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ABCD1	P33897	745 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	C21orf58	P58505	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	UFM1	P61960	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	HSPH1	Q92598	858 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF216-208	ENST00000479541	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms