RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 GDAQ9Y2T3 454 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-210ENST00000472326 I6L893 689 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 HSPB6O14558 160 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ANP32CO43423 234 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 HBP1O60381 514 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 WEE2P0C1S8 567 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CKMT1AP12532 417 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CDC25AP30304 524 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 AVPR1AP37288 418 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 DPP6P42658 865 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RASSF2P50749 326 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 GJB7Q6PEY0 223 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 KLHL31Q9H511 634 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 DGKBQ9Y6T7 804 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ARSBP15848 533 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 PMS2P54278 862 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 DUSP6Q16828 381 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SERPINA11Q86U17 422 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 APOLD1Q96LR9 279 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LHPPQ9H008 270 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GVT2 93 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CLDN7O95471 211 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RFX2P48378 723 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ENTPD1P49961 510 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CPOQ8IVL8 374 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CADM3Q8N126 398 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 GHDCQ8N2G8 530 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 REEP2Q9BRK0 252 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 MROH8Q9H579 483 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 IL1AP01583 271 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LCATP04180 440 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 PGGT1BP53609 377 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 EFR3AQ14156 821 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RPE65Q16518 533 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ME3Q16798 604 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 Q6ZSV7 163 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 MORC4Q8TE76 937 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 GCC1Q96CN9 775 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 PSMD1Q99460 953 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LUZP4Q9P127 313 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 INAFM1C9JVW0 142 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 KCNAB3O43448 404 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RGS14O43566 566 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ADAP00813 363 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 THBS3P49746 956 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CDH12P55289 794 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SLC18A3Q16572 532 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 ZNF333Q96JL9 665 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SUFUQ9UMX1 484 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LDB2O43679 373 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 LIASO43766 372 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A17O43808 307 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 CNTFP26441 200 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 YWHAQP27348 245 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 GPS2Q13227 327 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 USP38Q8NB14 1042 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 BICD2Q8TD16 824 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 HSPH1Q92598 858 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-210ENST00000472326 SLC32A1Q9H598 525 aa7.22□□□□□ -1.25
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