RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 ADH5P11766 374 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FOSL2P15408 326 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 TPSB2P20231 275 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 KCNA5P22460 613 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PSMB4P28070 264 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 MAGEA6P43360 314 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 SARNPP82979 210 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 CDK16Q00536 496 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 SLC20A2Q08357 652 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FCHO2Q0JRZ9 810 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 DMC1Q14565 340 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 KCNJ11Q14654 390 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 TPSAB1Q15661 275 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM182AQ5T1J6 154 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FAXCQ5TGI0 409 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 TRIM68Q6AZZ1 485 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PARM1Q6UWI2 310 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 Q7L0L9 218 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 APCDD1Q8J025 514 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 DCAF4L2Q8NA75 395 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 ACDQ96AP0 544 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 LMLNQ96KR4 655 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FCRL5Q96RD9 977 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 SH3GL2Q99962 352 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 GBA3Q9H227 469 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 PDFQ9HBH1 243 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 ABCB8Q9NUT2 735 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 SEPT3Q9UH03 358 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 FBXO10Q9UK96 956 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP5-209ENST00000465894 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 H3BQF6 201 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 TP73O15350 636 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 MBTPS2O43462 519 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 CACNG3O60359 315 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ZMPSTE24O75844 475 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ANXA9O76027 345 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 HLA-DQB2P05538 268 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 APRTP07741 180 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM153BP0C7A2 387 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ARSAP15289 507 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 NFKB1P19838 968 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 GLDCP23378 1020 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 CD70P32970 193 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ITKQ08881 620 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF235Q14590 738 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 PLEKHG6Q3KR16 790 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM153CQ494X1 144 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 RETSATQ6NUM9 610 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 LRIG3Q6UXM1 1119 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 CPA6Q8N4T0 437 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 NAT16Q8N8M0 369 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 MCUQ8NE86 351 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 PPM1EQ8WY54 764 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 HLA-CQ95604 372 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ASIC4Q96FT7 647 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 KXD1Q9BQD3 176 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 EBF3Q9H4W6 596 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ECT2Q9H8V3 914 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 NT5MQ9NPB1 228 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM153AQ9UHL3 310 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 VPS51Q9UID3 782 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 GGA2Q9UJY4 613 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 SNAP91O60641 907 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 CES1P23141 567 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 HLA-FP30511 346 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 DGKGP49619 791 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 NUMBP49757 651 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 GEMP55040 296 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ARL4CP56559 192 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 ARF5P84085 180 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP5-209ENST00000465894 SULT2A1Q06520 285 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms