RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TULP2	O00295	520 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	FLRT2	O43155	660 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	GREM1	O60565	184 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	HSF2BP	O75031	334 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PRKCH	P24723	683 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	HLA-F	P30511	346 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CSK	P41240	450 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CCT8	P50990	548 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ECT2L	Q008S8	904 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	MORC3	Q14149	939 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TTI2	Q6NXR4	508 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PMF1	Q6P1K2	205 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	LRRC31	Q6UY01	552 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	NAXD	Q8IW45	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SPATA20	Q8TB22	786 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	THAP9	Q9H5L6	903 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	DDIT4	Q9NX09	232 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RRN3	Q9NYV6	651 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CACNA1E	Q15878	2313 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PLXNA2	O75051	1894 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1B0GVM2	712 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ANKRD62	A6NC57	917 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	YKT6	O15498	198 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	IL1B	P01584	269 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PROS1	P07225	676 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	GLI1	P08151	1106 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TACR2	P21452	398 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PSMD8	P48556	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	KRT83	P78385	493 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SEMA3B	Q13214	749 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	NME3	Q13232	169 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PDCL	Q13371	301 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	POU4F3	Q15319	338 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	USP30	Q70CQ3	517 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF366	Q8N895	744 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	KDM1B	Q8NB78	822 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	TFAP2B	Q92481	460 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NCBP2-208	ENST00000455953	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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