RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MMP13P45452 471 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 BACE1P56817 501 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 GALNT3Q14435 633 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TSC22D1Q15714 1073 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CBWD6Q4V339 395 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 FAM171BQ6P995 826 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SUSD6Q92537 303 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TRIM2Q9C040 744 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.76□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 CHADO15335 359 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 RIPK2O43353 540 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 AVILO75366 819 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SNX4O95219 450 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 KLK7P49862 253 aa6.76□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 HECTD3Q5T447 861 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 METTL7BQ6UX53 244 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZPBP2Q6X784 338 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 APBA2Q99767 749 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MAP10Q9P2G4 905 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQ72 361 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 DHFRP00374 187 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TSHRP16473 764 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 USP46P62068 366 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TMCC2O75069 709 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 AMHP03971 560 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 POLD2P49005 469 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CCR3P51677 355 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CES5AQ6NT32 575 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CYLDQ9NQC7 956 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CBFA2T3O75081 653 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 NDUFS2O75306 463 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CCNDBP1O95273 360 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 PARP6Q2NL67 630 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 USP41Q3LFD5 358 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 RIT1Q92963 219 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CHKBQ9Y259 395 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 FCHO1O14526 889 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MDM4O15151 490 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 AMD1P17707 334 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 WEE1P30291 646 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ALDH3A2P51648 485 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 AP3S2P59780 193 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 GCNT1Q02742 428 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CRY1Q16526 586 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 EPC2Q52LR7 807 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.75□□□□□ -1.33
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