RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 K7ENM7 598 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MX2P20592 715 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMA3P25788 255 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ARRB2P32121 409 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 OPRL1P41146 370 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LGSNQ5TDP6 509 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LIN9Q5TKA1 542 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CPXCR1Q8N123 301 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SORT1Q99523 831 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf50Q9BV19 199 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX25Q9H3E2 840 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCH7Q9H992 704 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM86B1E9PN63 330 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF195O14628 629 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CLOCKO15516 846 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 JRKO75564 520 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CLIC3O95833 236 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 AMHP03971 560 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CSH1P0DML2 217 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CSH2P0DML3 217 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL4P12829 197 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CRHR1P34998 444 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MON1BQ7L1V2 547 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ELMOD1Q8N336 334 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 VAV3Q9UKW4 847 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CSADQ9Y600 493 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NEMP1O14524 444 aa8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 GSRP00390 522 aa8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD1Q719H9 257 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52B2Q96RD2 323 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 COG4Q9H9E3 785 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NANOGQ9H9S0 305 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR41Q9HAD4 459 aa8.52□□□□□ -1.04
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