RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM186AA6NE01 2351 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 F5P12259 2224 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRX2 142 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR27A2RRH5 827 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BML4 177 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN3O15551 220 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STX6O43752 255 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOM1L1O75674 476 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUSC2O75896 110 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBXN7O94888 489 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCNT3O95395 438 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMP15O95972 392 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4Q2P0C623 313 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCF2P10911 925 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 IDEP14735 1019 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDCP20711 480 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROZP22891 400 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1D2P34982 312 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LONP1P36776 959 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACOT2P49753 483 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GZMKP49863 264 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASP5P51878 434 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROR1Q01973 937 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK38Q15208 465 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPAQ15257 358 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPP1Q16831 310 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR149Q86SP6 731 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND1CQ8IV53 801 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STKLD1Q8NE28 680 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS33Q8NF86 280 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDAQ92838 391 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGMAQ96B86 450 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAAL1Q96ER3 474 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 AK8Q96MA6 479 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNRHR2Q96P88 292 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CGRRF1Q99675 332 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PANK2Q9BZ23 570 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNH6Q9H252 994 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA14Q9ULX7 337 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP205Q92621 2012 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYMKA6NI61 221 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRRG1O14668 218 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GALT2O43825 422 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOAT2O75908 522 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPBP17676 345 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASP1P29466 404 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHLH1Q02575 133 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREMQ03060 361 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SP140Q13342 867 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTM1Q13496 603 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFMIDQ63HM1 303 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 JADE1Q6IE81 842 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF280DQ6N043 979 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFCAB13Q8IY85 973 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITFG1Q8TB96 612 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms