RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 OXSMQ9NWU1 459 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN8A6NHC0 703 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 AVPR1AP37288 418 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB27AP51159 221 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 GRM3Q14832 879 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC20AQ6ZU45 233 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM44O43615 452 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 TM4SF4P48230 202 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A13Q96QE2 648 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC3O15379 428 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 THOP1P52888 689 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 CATSPER2Q96P56 530 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 DDIT4Q9NX09 232 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 JCHAINP01591 159 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 SBK3P0C264 359 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 TFEBP19484 476 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO4Q32M45 955 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 UBXN11Q5T124 520 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
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