RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 GZMAP12544 262 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 S100A2P29034 98 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFSF9P41273 254 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 POU5F1BQ06416 359 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PDK2Q15119 407 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTA3Q16772 222 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ERICH5Q6P6B1 374 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM139Q8IV31 216 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CHPFQ8IZ52 775 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RORBQ92753 470 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EXT2Q93063 718 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 OMDQ99983 421 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR88Q9GZN0 384 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GGA2Q9UJY4 613 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARL5CA6NH57 179 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C2orf81A6NN90 581 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 F8W810 466 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN4O14817 238 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NCK2O43639 380 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 APOC1P02654 83 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RBP3P10745 1247 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RARGP13631 454 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP3A5P20815 502 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARL2P36404 184 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL5P46777 297 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPKAPK2P49137 400 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS6KA3P51812 740 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NFYCQ13952 458 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DDR2Q16832 855 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ADCK2Q7Z695 626 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFB106AQ8N104 65 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IPMKQ8NFU5 416 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA18Q8TC71 538 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GIPC3Q8TF64 312 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SCUBE2Q9NQ36 999 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GIN1Q9NXP7 522 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO10Q9UK96 956 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RGPD5Q99666 1765 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0U1RQF3 1178 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TISP43B9A030 160 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TLR5O60602 858 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PRMT3O60678 531 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MICAL2O94851 1124 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IGSF6O95976 241 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 APODP05090 189 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 APRTP07741 180 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GJA5P36382 358 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 THOP1P52888 689 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GEMP55040 296 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MCL1Q07820 350 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 QPRTQ15274 297 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RFX8Q6ZV50 586 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AKAP14Q86UN6 197 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CACUL1Q86Y37 369 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms