RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.75□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.75□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.75□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KNL1Q8NG31 2342 aa8.75□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM72CH0Y354 149 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC30A4O14863 429 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MID1O15344 667 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDELR3O43731 214 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNAP91O60641 907 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PROSCO94903 275 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL1BP01584 269 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FECHP22830 423 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC25BP30305 580 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC1A1P43005 524 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTGER3P43115 390 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAPK8P45983 427 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ID4P47928 161 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMD8P48556 350 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUOXP51687 545 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF75DP51815 510 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARF5P84085 180 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERINC3Q13530 473 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDK2Q15119 407 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEAD4Q15561 434 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZVU0 165 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM72BQ86X60 149 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK40Q8N2I9 435 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCLK2Q8N568 766 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GANCQ8TET4 914 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB7BQ96AH8 199 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF599Q96NL3 588 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF670Q9BS34 389 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EDEM2Q9BV94 578 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR174Q9BXC1 333 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HDAC8Q9BY41 377 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC19Q9H756 370 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL36AQ9UHA7 158 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAI1Q9UI46 699 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DMTF1Q9Y222 760 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INVSQ9Y283 1065 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPTBN2O15020 2390 aa8.74□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LNP1A1A4G5 178 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM170AA1A519 330 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C10orf142B7Z368 130 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASA4BC9J798 803 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASA4O43374 803 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DFNA5O60443 496 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEC1O60732 1142 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LCA5LO95447 670 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGSF6O95976 241 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITPKAP23677 461 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGB7P26010 798 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD27P26842 260 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRNA3P32297 505 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRIA4P48058 902 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADPRHP54922 357 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OVGP1Q12889 678 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPYSQ14117 519 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPA17Q15506 151 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB6CQ53S08 254 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARD16Q5EG05 197 aa8.73□□□□□ -1.01
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms