RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 CBX4O00257 560 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 NUDT17P0C025 328 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 MPP3Q13368 585 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 GRIN2CQ14957 1233 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 FSCBQ5H9T9 825 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 KCTD11Q693B1 232 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 RETSATQ6NUM9 610 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 BHMTQ93088 406 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 TBX10O75333 385 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ADH1CP00326 375 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 CES1P23141 567 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 MAGEA3P43357 314 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PLK1P53350 603 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 BBS9Q3SYG4 887 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC38Q502W7 563 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 FNBP1LQ5T0N5 605 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM25Q86YD3 366 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PSKH2Q96QS6 385 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 LAMA3Q16787 3333 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 NFATC1O95644 943 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ABHD2P08910 425 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 GAD2Q05329 585 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 DMC1Q14565 340 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC14A2Q15849 920 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 CROCCP2Q86T23 111 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PLK2Q9NYY3 685 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PLAAQ9Y263 795 aa24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 F5H423 210 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 SPAG6O75602 509 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 TYRP14679 529 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PHBP35232 272 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ITKQ08881 620 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 LMAN2Q12907 356 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 PDGFRLQ15198 375 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF534Q76KX8 674 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 ALG14Q96F25 216 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 MGME1Q9BQP7 344 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 LINC00597Q9H2U6 94 aa24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3-201ENST00000379215 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ZMPSTE24O75844 475 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 VIPR2P41587 438 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ARF5P84085 180 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC20A2Q08357 652 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNJLQ8IV13 435 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP2A3Q93084 1043 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 C9orf72Q96LT7 481 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ZIM3Q96PE6 472 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NAT9Q9BTE0 207 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 VPS51Q9UID3 782 aa24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 OPA1O60313 960 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 IGFBP4P22692 258 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC29A2Q14542 456 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 KYNUQ16719 465 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 EML3Q32P44 896 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MSLNLQ96KJ4 702 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ACSL3O95573 720 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CPP00450 1065 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SULT2A1Q06520 285 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CDH17Q12864 832 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 DHCR24Q15392 516 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms