RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 CDH9Q9ULB4 789 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 HDAC3O15379 428 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 HCRTO43612 131 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 HOXC6P09630 235 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PRIM2P49643 509 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 RAB27AP51159 221 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 VSTM1Q6UX27 236 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MTA2O94776 668 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MMP3P08254 477 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 OGDHQ02218 1023 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 BNIP1Q12981 228 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 HGH1Q9BTY7 390 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 RBPJLQ9UBG7 517 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.38■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 LRPAP1P30533 357 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CCL23P55773 120 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PLD1Q13393 1074 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 SEMA5AQ13591 1074 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PSMD5Q16401 504 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 GSC2O15499 205 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 POU1F1P28069 291 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 GALNT3Q14435 633 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 DLG2Q15700 870 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PAGE1O75459 146 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 METTL18O95568 372 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 EPB42P16452 691 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 GPD2P43304 727 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CLCNKBP51801 687 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 LILRA4P59901 499 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 UBE3AQ05086 875 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PTPRNQ16849 979 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ADCK1Q86TW2 530 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 STK32CQ86UX6 486 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.37■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PPEF2O14830 753 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 KPNA6O60684 536 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 MPSTP25325 297 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ICAM3P32942 547 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ASPAP45381 313 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 VAC14Q08AM6 782 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 BFSP2Q13515 415 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 RETSATQ6NUM9 610 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ADGRD1Q6QNK2 874 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 DENND1CQ8IV53 801 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PTPRJQ12913 1337 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 SEC22BO75396 215 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 HLA-DPA1P20036 260 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 FASP25445 335 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 GRIA3P42263 894 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CHKBQ9Y259 395 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ZNF839A8K0R7 811 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 FFAR3O14843 346 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 GPR42O15529 346 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 SMPD1P17405 629 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 CDC16Q13042 620 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 TEX44Q53QW1 395 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 PLD3Q8IV08 490 aa16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYT6-201ENST00000369547 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms