RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KANSL1LA0AUZ9 987 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 HACD1B0YJ81 288 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CD160O95971 181 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SLC7A5Q01650 507 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF33AQ06730 810 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC14Q08ET2 396 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SNX1Q13596 522 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SLC45A4Q5BKX6 768 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MRGPRX3Q96LB0 322 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D17Q9HA65 648 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 LTB4R2Q9NPC1 389 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 PEX11BO96011 259 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 TARSP26639 723 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 PTGIRP43119 386 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 UBXN2BQ14CS0 331 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC105Q8IYK2 499 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF687Q8N1G0 1237 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SEC14L1Q92503 715 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 RAB17Q9H0T7 212 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 HS3ST2Q9Y278 367 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ATG2BQ96BY7 2078 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 BDP1A6H8Y1 2624 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 NCOR1O75376 2440 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 K7ERQ8 282 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MATN3O15232 486 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 TTI1O43156 1089 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 VAV1P15498 845 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SLC20A2Q08357 652 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ATP11CQ8NB49 1132 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ATL2Q8NHH9 583 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FOXQ1Q9C009 403 aa30.11■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK1O00180 336 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ERLIN1O75477 346 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SRCP12931 536 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 RBL1P28749 1068 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 TIE1P35590 1138 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CLCN6P51797 869 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 LMNB2Q03252 620 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF234Q14588 700 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO43Q4G163 708 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D3CQ8N5H7 860 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MYO19Q96H55 970 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF599Q96NL3 588 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MUC3AQ02505 3323 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 STK25O00506 426 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNB1P11230 501 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ST8SIA6P61647 398 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 GUCY2DQ02846 1103 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SLC10A7Q0GE19 358 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf27AQ580R0 203 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 TMCO4Q5TGY1 634 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 JAMLQ86YT9 394 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 NSMCE1Q8WV22 266 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FATE1Q969F0 183 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 NELL2Q99435 816 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 SEPT10Q9P0V9 454 aa30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FAM170BA6NMN3 283 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ECEL1O95672 775 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CCNB1P14635 433 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 NNMTP40261 264 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 LBRQ14739 615 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 OASLQ15646 514 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 HTR3CQ8WXA8 447 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 MAML1Q92585 1016 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 ACOX2Q99424 681 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM121Q9BTD3 319 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 EPB41L5Q9HCM4 733 aa30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ECHS1-201ENST00000368547 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms