RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf52Q8NHV5 167 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF1BPQ96EK5 621 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOPT1Q96IL0 206 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMOQ9BU70 441 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGXT2Q9BYV1 514 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC32A1Q9H598 525 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf56Q9H5V9 222 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 VEZTQ9HBM0 779 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH22Q9UJ99 828 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP2CQ9Y3L5 183 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLDN16Q9Y5I7 305 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JK05 382 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NNC1 897 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNMTO43148 476 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX18O95935 607 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGBP02675 491 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNGP13051 313 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLCD1P51178 756 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 BLKP51451 505 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR1H2P55055 460 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPP1Q00013 466 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ME3Q16798 604 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC142Q17RM4 750 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO43Q4G163 708 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYTL3Q4VX76 610 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D9BQ66K14 1250 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAAH2Q6GMR7 532 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL20RBQ6UXL0 311 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRM2BQ7LG56 351 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAATS1Q7Z4T9 603 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHD1LQ86WJ1 897 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMC8Q8IUR7 673 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPHOSPH8Q99549 860 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA5Q9GZZ9 404 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZHX3Q9H4I2 956 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TASP1Q9H6P5 420 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 PREBQ9HCU5 417 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRAK4Q9NWZ3 460 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLKQ9UBE8 527 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEMTQ9UBM1 199 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 COG5Q9UP83 839 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PPC1 479 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP10A1A4S6 786 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf102A2RUQ5 167 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR91A4D1P6 747 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX22C9J3V5 150 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MDM4O15151 490 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 F9P00740 461 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 URODP06132 367 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP3P08254 477 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNB1P11230 501 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRF1P14222 555 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU1F1P28069 291 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFSF8P32971 234 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPP6P42658 865 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCT4P50991 539 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARSFP54793 590 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASP6P55212 293 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMPRSS3P57727 454 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms