RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-201ENST00000359785 DPP6P42658 865 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SLC1A6P48664 564 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 WNT7BP56706 349 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ECT2LQ008S8 904 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 BNC1Q01954 994 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CEACAM7Q14002 265 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TFDP1Q14186 410 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 STILQ15468 1287 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ARTNQ5T4W7 220 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZPBP2Q6X784 338 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 FAM124AQ86V42 546 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 WDR49Q8IV35 697 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PDIK1LQ8N165 341 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ESX1Q8N693 406 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SPERTQ8NA61 448 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 FCGR1BQ92637 280 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CEP19Q96LK0 163 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GPR78Q96P69 363 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GPR22Q99680 433 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TRIM15Q9C019 465 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PSTPIP2Q9H939 334 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 OSER1Q9NX31 292 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 MKLN1Q9UL63 735 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CLDN25C9JDP6 229 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 VWA5AO00534 786 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 COPEO14579 308 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CYP2C8P10632 490 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GYS1P13807 737 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 BGNP21810 368 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PIK3R1P27986 724 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 AXLP30530 894 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ICAM3P32942 547 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SERPINB6P35237 376 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GRIA4P48058 902 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 THOP1P52888 689 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TGFB2P61812 414 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 USP4Q13107 963 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CUL2Q13617 745 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 MFSD10Q14728 455 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 RAB39AQ14964 217 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 DSELQ8IZU8 1212 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SVOPLQ8N434 492 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 C8orf37Q96NL8 207 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 NLRP3Q96P20 1036 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 RBBP8Q99708 897 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PKP2Q99959 881 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 AMNQ9BXJ7 453 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 HMG20AQ9NP66 347 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 LINC00862A6NCI5 91 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 USP17L5A8MUK1 530 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 B8ZZF3 427 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ARNTLO00327 626 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ACKR2O00590 384 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 HDAC3O15379 428 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 VPS4BO75351 444 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms