RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 MYH4Q9Y623 1939 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ABLIM1O14639 778 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ULK1O75385 1050 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 COX7A2P14406 83 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 S100A3P33764 101 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 OLR1P78380 273 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 IKBKEQ14164 716 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TMC7Q7Z402 723 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 PDHXO00330 501 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 OTCP00480 354 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 LBPP18428 481 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TYMPP19971 482 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 PLK4O00444 970 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TGDSO95455 350 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ADH1CP00326 375 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CPA2P48052 419 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 NDST1P52848 882 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MAMLD1Q13495 774 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 AMHR2Q16671 573 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 EPC2Q52LR7 807 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 KRT77Q7Z794 578 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 H3BN98 237 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 RAG1P15918 1043 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 AKAP5P24588 427 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 IL5RAQ01344 420 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CBWD6Q4V339 395 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAM25AB3EWG3 89 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAM25CB3EWG5 89 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAM25GB3EWG6 89 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MRASO14807 208 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 NBNO60934 754 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MICAL2O94851 1124 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ERVK-9P63128 1117 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FUT11Q495W5 492 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 C2CD6Q53TS8 623 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FCHO1O14526 889 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FSBPO95073 299 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ADORA2AP29274 412 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CAPGP40121 348 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 LIN54Q6MZP7 749 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 POTEHQ6S545 545 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 SUSD6Q92537 303 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 OSMRQ99650 979 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT17P0C025 328 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ERCC2P18074 760 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CYP3A7P24462 503 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 LGALS3BPQ08380 585 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 CES5AQ6NT32 575 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 MYLPFQ96A32 169 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF607Q96SK3 696 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 INVSQ9Y283 1065 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 H3BNX3 289 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H2ABP04908 130 aa6.09□□□□□ -1.43
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