RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ATL2Q8NHH9 583 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 RUNDC3BQ96NL0 473 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 LTB4R2Q9NPC1 389 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SEPT3Q9UH03 358 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 TMCC1O94876 653 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 MMP13P45452 471 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SEC13P55735 322 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SLC10A7Q0GE19 358 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC32Q14392 662 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF234Q14588 700 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 TEX26Q8N6G2 289 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CEP112Q8N8E3 955 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 GRK7Q8WTQ7 553 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 EDAQ92838 391 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CEP44Q9C0F1 390 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 USP29Q9HBJ7 922 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 AMACRQ9UHK6 382 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SGK1O00141 431 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ATP9BO43861 1147 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KCNJ1P48048 391 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 UBXN2BQ14CS0 331 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 MYO19Q96H55 970 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 IL12RB2Q99665 862 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 L2HGDHQ9H9P8 463 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D17Q9HA65 648 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 JCHAINP01591 159 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN3P26045 913 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ACCSLQ4AC99 568 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TEX44Q53QW1 395 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 EMC10Q5UCC4 262 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TTC27Q6P3X3 843 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 GSTA5Q7RTV2 222 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SYNPOQ8N3V7 929 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 FAM71DQ8N9W8 422 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 USP33Q8TEY7 942 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 K7ERQ8 282 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RNF103O00237 685 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TARSP26639 723 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TIE1P35590 1138 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB17Q13105 803 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 DLG2Q15700 870 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL7Q8IXQ5 586 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CHPFQ8IZ52 775 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PSKH2Q96QS6 385 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TRHDEQ9UKU6 1024 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 HCN2Q9UL51 889 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE15A4D2H0 777 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE8P0CG41 777 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ALADP13716 330 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RHOAP61586 193 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 WASHC5Q12768 1159 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CYTH1Q15438 398 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 C22orf39Q6P5X5 142 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE6Q86UF2 777 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE4Q8IX94 777 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ALLCQ8N6M5 410 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC89Q8N998 374 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RTP4Q96DX8 246 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PCYOX1Q9UHG3 505 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 STK25O00506 426 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RNF40O75150 1001 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CHRNB1P11230 501 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ACTN2P35609 894 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 GDF10P55107 478 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf54Q08AI8 447 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf27AQ580R0 203 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF687Q8N1G0 1237 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM245Q9H330 911 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 NT5MQ9NPB1 228 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 C5orf60A6NFR6 353 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 FAM170BA6NMN3 283 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 GAS8O95995 478 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 IFNB1P01574 187 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 IL12RB1P42701 662 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SDE2Q6IQ49 451 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TEKT5Q96M29 485 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CEP41Q9BYV8 373 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 FOXQ1Q9C009 403 aa28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 NCOR1O75376 2440 aa28.22■■■□□ 2.11
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