RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 UROC1Q96N76 676 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 MYOCQ99972 504 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 NTRK1P04629 796 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 DDR1Q08345 913 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 PCID2Q5JVF3 399 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 MYL12BO14950 172 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY6O43306 1168 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D12O60347 775 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 MYL12AP19105 171 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM199Q8N511 208 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 COG5Q9UP83 839 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 STK40Q8N2I9 435 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 APOL4Q9BPW4 351 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 ACAP1Q15027 740 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 IL22Q9GZX6 179 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 TTC7BQ86TV6 843 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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