RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CYS1Q717R9 158 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCNJLQ8IV13 435 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 FATE1Q969F0 183 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TCF25Q9BQ70 676 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 BFARQ9NZS9 450 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM159BA6NKW6 160 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PSMD3O43242 534 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 UGT1A9O60656 530 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SPAG7O75391 227 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC8A1P32418 973 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 RENBPP51606 427 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 IL9RQ01113 521 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SERINC3Q13530 473 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNF43Q68DV7 783 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TXNDC8Q6A555 127 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NAT9Q9BTE0 207 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ECT2Q9H8V3 914 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SP110Q9HB58 689 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SENP1Q9P0U3 644 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ASB3Q9Y575 518 aa20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NEBLO76041 1014 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ALDH1A2O94788 518 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ASMTLO95671 621 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ADH1AP07327 375 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TPH1P17752 444 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CTNNB1P35222 781 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NUMBP49757 651 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PARP15Q460N3 678 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CES3Q6UWW8 571 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 FITM2Q8N6M3 262 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NOD2Q9HC29 1040 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 HIDE1A8MVS5 230 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 H3BNC9 293 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ANXA9O76027 345 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SGSHP51688 502 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CRYMQ14894 314 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ADGRF1Q5T601 910 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 MARC1Q5VT66 337 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 GAREM2Q75VX8 874 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SMC6Q96SB8 1091 aa20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATP9BO43861 1147 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 DNAJB1P25685 340 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 GABRR2P28476 465 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NPY2RP49146 381 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZXDBP98169 803 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 IL10RBQ08334 325 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 MGAT5Q09328 741 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 IPMKQ8NFU5 416 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 NT5MQ9NPB1 228 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 A0A0D9SEW6 157 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRG1P02750 347 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 C8AP07357 584 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 KRT4P19013 534 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 HDCP19113 662 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 GEMP55040 296 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDH4P55283 916 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 KCNJ2P63252 427 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDH17Q12864 832 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 LINC00523Q86TU6 105 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TEX26Q8N6G2 289 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TTC17Q96AE7 1141 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRRC3Q9BY71 257 aa20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY3-201ENST00000329553 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 259 ms