RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 VWA8A3KMH1 1905 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB16A2A368 324 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf78A6NCI8 922 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 AVILO75366 819 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTN5O94779 1100 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CPP00450 1065 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN2P17706 415 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NR1D1P20393 614 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMB4P28070 264 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO1A2P46721 670 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GAD2Q05329 585 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LONRF1Q17RB8 773 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ALFQ53S48 1182 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MARC1Q5VT66 337 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNDC8Q6A555 127 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CNPY4Q8N129 248 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2S1Q96SQ9 504 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IL12RB2Q99665 862 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP41Q9BYV8 373 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEH1Q9H213 219 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SP110Q9HB58 689 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ASAH2Q9NR71 780 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NDFIP2Q9NV92 336 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.761e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC24A2Q9UI40 661 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HIDE1A8MVS5 230 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 XYLBO75191 536 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SUN1O94901 812 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 AP2A1O95782 977 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SSTR1P30872 391 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HPDP32754 393 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 STX2P32856 288 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ETFBP38117 255 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MSH2P43246 934 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA3P43357 314 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNAR2P48551 515 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NPY2RP49146 381 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GYS2P54840 703 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GEMP55040 296 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GPX6P59796 221 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IL10RBQ08334 325 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB17Q13105 803 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RASA2Q15283 850 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ARTNQ5T4W7 220 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LGSNQ5TDP6 509 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NADSYN1Q6IA69 706 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM7AQ6ZMT4 941 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CYS1Q717R9 158 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST9Q7L1S5 443 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRPQ86YL5 185 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 BBS5Q8N3I7 341 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SH2D3CQ8N5H7 860 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAAF3Q8N9W5 541 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LEMD2Q8NC56 503 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FCRL5Q96RD9 977 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CORO1BQ9BR76 489 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GLOD4Q9HC38 313 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SMPD4Q9NXE4 827 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 STOML2Q9UJZ1 356 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRDP23468 1912 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 BRCA2P51587 3418 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms