RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 E7EVH7 732 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC20A2Q08357 652 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPSAP1Q14558 356 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM182AQ5T1J6 154 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC44A3Q8N4M1 653 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX26Q8N6G2 289 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GBA3Q9H227 469 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANAPC5Q9UJX4 755 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 XIRP2A4UGR9 3374 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf42Q9H799 3197 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARNTLO00327 626 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CISD3P0C7P0 127 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL9P15248 144 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC6A11P48066 632 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMAN1P49257 510 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAB4Q2WGN9 574 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBLAC2Q68D91 279 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTD1Q8N815 330 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOFQ9NZM1 2061 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHROOM3Q8TF72 1996 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM24O15164 1050 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DQB2P05538 268 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 IVDP26440 423 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAXCQ5TGI0 409 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR93Q6P2C0 686 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT18Q6ZVK8 323 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETNK1Q9HBU6 452 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLOD4Q9HC38 313 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6CA6NDK9 693 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6BA6NDN3 693 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL18O95568 372 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6DP0CG33 693 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFKB1P19838 968 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMB4P28070 264 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECT2LQ008S8 904 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAV1Q03135 178 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDSRQ06136 332 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRADDQ15628 312 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GEN1Q17RS7 908 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIL6Q8IXY8 311 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP11CQ8NB49 1132 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM129AQ9BZQ8 928 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIPCQ9C0C6 399 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM6Q9NQX0 595 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTL7AQ9Y615 435 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHD5Q8TDI0 1954 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 F5H423 210 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMCC1O94876 653 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARSP49589 748 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA8P53708 1063 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLTPP55058 493 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSNL1P62760 191 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADIPOR2Q86V24 386 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC4Q96A65 974 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC17Q96AE7 1141 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPV5Q9NQA5 729 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMM44O43615 452 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASLP04424 464 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASGR2P07307 311 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF8P28908 595 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD68P34810 354 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 NNMTP40261 264 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPRD1P41143 372 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MORF4L2Q15014 288 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSKH2Q96QS6 385 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRHL1Q9NZI5 618 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 THEGQ9P2T0 379 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3BA6NDS4 549 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMAPO00193 183 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA9O76027 345 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 APRTP07741 180 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 PFKPQ01813 784 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYTH1Q15438 398 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPT1BQ92523 772 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNASE1L2Q92874 299 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCRL5Q96RD9 977 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A51Q9H1U9 297 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB21Q9UL25 225 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFU1Q9UMS0 254 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC8A2Q9UPR5 921 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms