RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316843.8

LLGL1-201, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL1, Length 4,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-201ENST00000316843 LIMK2P53671 638 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 STX5Q13190 355 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 GK5Q6ZS86 529 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SNX27Q96L92 541 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF778Q96MU6 729 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PFKMP08237 780 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CHRNA4P43681 627 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 BRCC3P46736 316 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 RALGDSQ12967 914 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CXorf38Q8TB03 319 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CYGBQ8WWM9 190 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CNDP1Q96KN2 507 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 DSEQ9UL01 958 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MAGEB16A2A368 324 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TOMM70O94826 608 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 AP2A1O95782 977 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MYL4P12829 197 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PSMC3P17980 439 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 DLG1Q12959 904 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SNX17Q15036 470 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 EFHBQ8N7U6 833 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CYLDQ9NQC7 956 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 AHCYL1O43865 530 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FBXO21O94952 628 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 GEMP55040 296 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FAM35AQ86V20 835 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ABI1Q8IZP0 508 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MZB1Q8WU39 189 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ALG9Q9H6U8 611 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ABLIM1O14639 778 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MMP3P08254 477 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 EPHX2P34913 555 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 EFEMP1Q12805 493 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SFT2D3Q587I9 215 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 LIPMQ5VYY2 423 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SUN2Q9UH99 717 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SUPT3HO75486 399 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 UQCRBP14927 111 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 LHX1P48742 406 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MAPRE2Q15555 327 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 BHMTQ93088 406 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.62□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 DAB1O75553 588 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 THPOP40225 353 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PPIL2Q13356 520 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF786Q8N393 782 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PCED1BQ96HM7 432 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 DPYSL4O14531 572 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ITGAXP20702 1163 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 RAP1GDS1P52306 607 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CHN2P52757 468 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF280DQ6N043 979 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 OSTM1Q86WC4 334 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 GNGT2O14610 69 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PSMD3O43242 534 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms