RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 KLQ9UEF7 1012 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NARFQ9UHQ1 456 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 A0A1W2PQ67 120 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 G3V3G9 751 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TK2O00142 265 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 DLGAP1O14490 977 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 GRID2O43424 1007 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NCAM1P13591 858 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ARSAP15289 507 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PDGFRAP16234 1089 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TNK2Q07912 1038 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PDK2Q15119 407 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 DOK7Q18PE1 504 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TKFCQ3LXA3 575 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 C4orf19Q8IY42 314 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NETO2Q8NC67 525 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NRBF2Q96F24 287 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CEP41Q9BYV8 373 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TASP1Q9H6P5 420 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 KLHL3Q9UH77 587 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TIMM22Q9Y584 194 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ZBBXA8MT70 800 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 STK25O00506 426 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ELK4P28324 431 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 GP5P40197 560 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PTPN9P43378 593 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SLC7A2P52569 658 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF132P52740 706 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CLCQ05315 142 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 STX5Q13190 355 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF846Q147U1 533 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 INAVAQ3KP66 663 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SLC36A3Q495N2 470 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 LDHDQ86WU2 507 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 ANKFN1Q8N957 763 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CALML6Q8TD86 181 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SNX19Q92543 992 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 CSF3RQ99062 836 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 VPS33BQ9H267 617 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 HMG20AQ9NP66 347 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 IFT52Q9Y366 437 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 EI24O14681 340 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 AURKAO14965 403 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 GUCY1B2O75343 617 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 GCATO75600 419 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MT-CO1P00395 513 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 MT-ND1P03886 318 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN3-201ENST00000308478 C2P06681 752 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms