RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trpm5Q9JJH7 1158 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp985A2A7A5 519 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cntnap3E9PY62 1287 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm3264L7N2C5 238 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cyp2c39P56656 490 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Il6stQ00560 917 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ubxn2bQ0KL01 331 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Osbp2Q5QNQ6 908 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 CybbQ61093 570 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ssxb3Q6XAS4 170 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bmp3Q8BHE5 468 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atg14Q8CDJ3 492 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rdh13Q8CEE7 334 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acap1Q8K2H4 740 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sgpl1Q8R0X7 568 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 TmlheQ91ZE0 421 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 PirQ9D711 290 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dus2Q9D7B1 493 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cib1Q9Z0F4 191 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arid3bQ9Z1N7 568 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mtm1Q9Z2C5 603 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fibcd1A2AV25 459 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr726E9Q8X3 321 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm3336J3QMQ6 198 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 NmbrO54799 390 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cyp2b10P12791 500 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Icam1P13597 537 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Grm1P97772 1199 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr725Q05A45 321 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Meaf6Q2VPQ9 191 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 McuQ3UMR5 350 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mfsd3Q5U419 412 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Abcd2Q61285 741 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 IqceQ6PCQ0 778 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rxfp1Q6R6I7 758 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ssx9Q6XAS3 170 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Clec4b1Q7TS58 209 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cyp2c70Q91W64 489 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ecrg4Q99LS0 148 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pbld2Q9CXN7 288 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 PtsQ9R1Z7 144 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Usp51B1AY15 661 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r84D3YWE3 849 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm7942L7N277 499 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 PtprcP06800 1291 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chrm1P12657 460 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 TubP50586 505 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Morf4l1P60762 362 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pcsk1P63239 753 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr297Q7TS07 310 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 GnsQ8BFR4 544 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lca5lQ8C0X0 741 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf276Q8CE64 614 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acbd6Q9D061 282 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 A0A1Y7VP24 259 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hcn4O70507 1186 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dpep1P31428 410 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 LdlrP35951 862 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bop1P97452 732 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr162Q3UN16 588 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 DdnQ80TS7 710 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dennd1cQ8CFK6 786 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mospd1Q8VEL0 213 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mapk13Q9Z1B7 366 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm28168A0A087WNP1 180 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1022L7MTT3 315 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Asgr1P34927 284 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Agtr2P35374 363 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfm3P63056 478 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Agap2Q3UHD9 1186 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mief2Q5NCS9 454 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lin52Q8CD94 116 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Taf12Q8VE65 161 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 BsndQ8VIM4 307 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 CacybpQ9CXW3 229 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Agpat3Q9D517 376 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ifi30Q9ESY9 248 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nccrp1G3X9C2 266 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm7971J3QMM8 481 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr603L7N1Y4 312 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scamp3O35609 349 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Marveld2Q3UZP0 555 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rbm44Q3V089 1013 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr65Q61038 337 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wbp4Q61048 376 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem130Q6NXM3 419 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem121Q80XA0 318 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.2 ms