RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MAML3Q96JK9 1138 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ASAH2Q9NR71 780 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ITM2BQ9Y287 266 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KCNK1O00180 336 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZW10O43264 779 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MLYCDO95822 493 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A4P14672 509 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PSMC3P17980 439 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NFKB1P19838 968 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CD86P42081 329 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SGCGQ13326 291 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SQLEQ14534 574 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACOX1Q15067 660 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NR6A1Q15406 480 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KAT2BQ92831 832 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CATSPER2Q96P56 530 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RNF208Q9H0X6 261 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 COL20A1Q9P218 1284 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DYTNA2CJ06 578 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SYN3O14994 580 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MDM4O15151 490 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB14O43829 449 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GNRH1P01148 92 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FGF1P05230 155 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ADH1AP07327 375 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ETS1P14921 441 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GOT1P17174 413 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN9P43378 593 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NPY5RQ15761 445 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PHKG1Q16816 387 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PARP15Q460N3 678 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 POTEHQ6S545 545 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 STK32AQ8WU08 396 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 AP4S1Q9Y587 144 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0U1RQJ8 604 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FSBPO95073 299 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PGK1P00558 417 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SELPP16109 830 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LAG3P18627 525 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CDC25CP30307 473 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MAPK9P45984 424 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GABRB2P47870 512 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RAB10P61026 200 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD5Q16401 504 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PDK4Q16654 411 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 INSCQ1MX18 579 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 AADATQ8N5Z0 425 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATL1Q8WXF7 558 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 THAP11Q96EK4 314 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACOX2Q99424 681 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BTN3A1O00481 513 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAM163BP0C2L3 166 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ERVK-10P10266 1014 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FMO4P31512 558 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MMRN1Q13201 1228 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FIBCD1Q8N539 461 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2E3Q969T4 207 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CNBD2Q96M20 576 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.361e-9■■■■■ 50.9
PDE4D-228ENST00000636120 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PARVBQ9HBI1 364 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OPTCQ9UBM4 332 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 Q9Y3F1 56 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HES2Q9Y543 173 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms