RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 COL15A1P39059 1388 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 OR14I1A6ND48 311 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ARL5CA6NH57 179 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TSPAN3O60637 253 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 AMHP03971 560 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ALDH2P05091 517 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PGAM1P18669 254 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ME2P23368 584 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 NUMBP49757 651 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CDKL1Q00532 357 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNMA1Q12791 1236 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MAPK7Q13164 816 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MTF1Q14872 753 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 BROXQ5VW32 411 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CACUL1Q86Y37 369 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 AADATQ8N5Z0 425 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF615Q8N8J6 731 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RIT2Q99578 217 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CPNE1Q99829 537 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 POMKQ9H5K3 350 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RRN3Q9NYV6 651 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 NARFQ9UHQ1 456 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 VPS4AQ9UN37 437 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC28A1O00337 649 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SH3BGRLO75368 114 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CELF2O95319 508 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DHFRP00374 187 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 POMCP01189 267 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 HSD3B1P14060 373 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SERPINA4P29622 427 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 OR1E1P30953 314 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RIPK1Q13546 671 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 EPC2Q52LR7 807 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CEP68Q76N32 757 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GPSM1Q86YR5 675 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXO30Q8TB52 745 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SETD6Q8TBK2 473 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DCLK3Q9C098 648 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ABCB10Q9NRK6 738 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TBX20Q9UMR3 447 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GPSM3Q9Y4H4 160 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ATP10AO60312 1499 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1B0GTH6 734 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MAP3K6O95382 1288 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PRH1P02810 166 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 S100A2P29034 98 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SCTRP47872 440 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GJA8P48165 433 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DNASE1L1P49184 302 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RAB27AP51159 221 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TKTL1P51854 596 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms