RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 GOT1P17174 413 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ITGA9Q13797 1035 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 MAP7Q14244 749 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 MKS1Q9NXB0 559 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SDR42E2A6NKP2 422 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 H7C0C1 242 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CCNFP41002 786 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ATP5OP48047 213 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC11A1P49279 550 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ROR1Q01973 937 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 MYBPC3Q14896 1274 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CHI3L2Q15782 390 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 PREBQ9HCU5 417 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.79■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CXCL10P02778 98 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 TGM2P21980 687 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 WASHC5Q12768 1159 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 PYDC1Q8WXC3 89 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 MARCH5Q9NX47 278 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF180Q9UJW8 692 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.78■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 AQP4P55087 323 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 GBE1Q04446 702 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 LPCAT4Q643R3 524 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SATL1Q86VE3 508 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 DDIT4Q9NX09 232 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 USP3Q9Y6I4 520 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 TTC3P53804 2025 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF487B1APH4 448 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 AMHP03971 560 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC5A3P53794 718 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 INHBCP55103 352 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 DLG1Q12959 904 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CCNIQ14094 377 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 GALNT8Q9NY28 637 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.77■□□□□ 0.6
AP000997.3-201ENST00000623333 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 SYN3O14994 580 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 RFPL1O75677 317 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 KRT37O76014 449 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 CHN2P52757 468 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 BTKQ06187 659 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 PDK3Q15120 406 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 IRGQQ8WZA9 623 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 JADE3Q92613 823 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 RILPQ96NA2 401 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 TOX2Q96NM4 488 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 MEI4A8MW99 385 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 I6L893 689 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 TNFRSF10BO14763 440 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 PEX1O43933 1283 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 ITGA2BP08514 1039 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 KITP10721 976 aa18.76■□□□□ 0.59
AP000997.3-201ENST00000623333 ARL4AP40617 200 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms