RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 AK5Q9Y6K8 562 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 I6L893 689 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SNAP91O60641 907 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ACP1P24666 158 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNA3P32297 505 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ABCG1P45844 678 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 BRMS1LQ5PSV4 323 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A45Q8N413 288 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 TMIEQ8NEW7 156 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 RFFLQ8WZ73 363 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 NT5C3BQ969T7 300 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 VPS51Q9UID3 782 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 MYLKQ15746 1914 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQU0 124 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 K7ERQ8 282 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM38O00635 465 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SLC31A1O15431 190 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SIGLEC6O43699 453 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 RHOCP08134 193 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC114Q96M63 670 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL11Q9NVR0 708 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.687e-6■□□□□ 8.6
PTPRF-216ENST00000617451 DRGXA6NNA5 263 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 THEGLP0DJG4 465 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PRLRP16471 622 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 RRM1P23921 792 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ITPKBP27987 946 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF284Q2VY69 593 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 HORMAD1Q86X24 394 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KLK6Q92876 244 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ARRDC3Q96B67 414 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 STAP1Q9ULZ2 295 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KALRNO60229 2985 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0D9SEW6 157 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DGKAP23743 735 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CLCN6P51797 869 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 KCNMA1Q12791 1236 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF4L2Q8NA75 395 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CHST14Q8NCH0 376 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf74Q96LT6 269 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 MYOCQ99972 504 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CLCA2Q9UQC9 943 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 RNF103O00237 685 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 F9P00740 461 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PRNPP04156 253 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 GLDCP23378 1020 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 SULT1E1P49888 294 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ARTNQ5T4W7 220 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC31Q6UY01 552 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 LINGO4Q6UY18 593 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC8Q9BY41 377 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DYRK4Q9NR20 520 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 UCKL1Q9NWZ5 548 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 AKT2P31751 481 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 GABRB2P47870 512 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 BPIFB4P59827 614 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 E2F1Q01094 437 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DEUP1Q05D60 604 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK4Q16566 473 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A52Q3SY17 297 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 OR4C6Q8NH72 309 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TBCBQ99426 244 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 FZD3Q9NPG1 666 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM51Q9NW97 253 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 MPP6Q9NZW5 540 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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