RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	KLK6	Q92876	244 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CLMP	Q9H6B4	373 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417		E5RJQ4	531 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417		K7ESM1	405 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GLI1	P08151	1106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PPP1R2	P41236	205 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CDH4	P55283	916 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TAS2R38	P59533	333 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PNOC	Q13519	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417		Q6ZSR6	202 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	OR13H1	Q8NG92	308 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GLMN	Q92990	594 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	KAT5	Q92993	513 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ALG14	Q96F25	216 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MED8	Q96G25	268 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	THAP12	O43422	761 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CALCA	P01258	141 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CLCN6	P51797	869 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	LY6D	Q14210	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	HSF2BP	O75031	334 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CSF2	P04141	144 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RHOC	P08134	193 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GIMD1	P0DJR0	217 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SRC	P12931	536 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GNA15	P30679	374 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RABIF	P47224	123 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RPIA	P49247	311 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CLDN2	P57739	230 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CENPC	Q03188	943 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	NME3	Q13232	169 aa		11.66	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms