RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 I6L893 689 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QYT0 321 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FFAR2O15552 330 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-CO3P00414 261 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA3P32297 505 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH4P55283 916 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 DAB2P98082 770 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MTA1Q13330 715 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ALFQ53S48 1182 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ERICH1Q86X53 443 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP11CQ8NB49 1132 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13H1Q8NG92 308 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SHC3Q92529 594 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGVQ9NUD9 493 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL11Q9NVR0 708 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS51Q9UID3 782 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX10Q9Y5X0 201 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KNTC1P50748 2209 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TK2O00142 265 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMD1P0DJR0 217 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 RRM1P23921 792 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F1Q01094 437 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf57Q0VDD7 668 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D25Q3MII6 688 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 HORMAD1Q86X24 394 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF683Q8IZ20 524 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST14Q8NCH0 376 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 NOX5Q96PH1 765 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CALN1Q9BXU9 219 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 APEX2Q9UBZ4 518 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MYLKQ15746 1914 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ASXL3Q9C0F0 2248 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY5O95622 1261 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOCP08134 193 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 NOS2P35228 1153 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTN2P35609 894 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN2P57739 230 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT83P78385 493 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TLE3Q04726 772 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK5Q6P3R8 708 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNT7Q6ZNI0 430 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A9Q7LBE3 791 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM81BQ96LP2 452 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PIAS2O75928 621 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 AKT2P31751 481 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A3Q01959 620 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SEL1L3Q68CR1 1132 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 LINGO4Q6UY18 593 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC6Q7Z403 805 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SPACA3Q8IXA5 215 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TMIEQ8NEW7 156 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC114Q96M63 670 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 NPY6RQ99463 290 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TKTL2Q9H0I9 626 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0D9SEW6 157 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 MYF5P13349 255 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 HS1BP3Q53T59 392 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF4L2Q8NA75 395 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TNKS2Q9H2K2 1166 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK9Q9BZ29 2069 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PRNPP04156 253 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CKMT1AP12532 417 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCR3P49682 368 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCP2Q5VXM1 449 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf39Q6P5X5 142 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP6Q6ZN66 633 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR155Q7Z3F1 870 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 WDCPQ9H6R7 721 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNCQ9H7C4 482 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 DYRK4Q9NR20 520 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 OPA1O60313 960 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH8O95206 1070 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PON1P27169 355 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1E1P49888 294 aa26.22■■□□□ 1.79
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