RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SIK2	Q9H0K1	926 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	GAN	Q9H2C0	597 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514		M0QYT0	321 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	PLK4	O00444	970 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	WNT9A	O14904	365 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	PAGE1	O75459	146 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	LCA5L	O95447	670 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CAPNS1	P04632	268 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SERPING1	P05155	500 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	NOS2	P35228	1153 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	KLK7	P49862	253 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	METAP1	P53582	386 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ADPRH	P54922	357 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ACCSL	Q4AC99	568 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	KIF18A	Q8NI77	898 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SKA1	Q96BD8	255 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ALG14	Q96F25	216 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC42	Q96M95	316 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SPAG5	Q96R06	1193 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	VPS28	Q9UK41	221 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514		A0A1B0GTQ1	180 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM170A	A1A519	330 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	C10orf142	B7Z368	130 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	TNFSF14	O43557	240 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	DFNA5	O60443	496 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CLDN11	O75508	207 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	GFPT2	O94808	682 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	DKK1	O94907	266 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	UCHL3	P15374	230 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CD38	P28907	300 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	DRD3	P35462	400 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	MTA1	Q13330	715 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	DLG2	Q15700	870 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC157	Q569K6	752 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	PROSER1	Q86XN7	944 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SERAC1	Q96JX3	654 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	PIGV	Q9NUD9	493 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	SARDH	Q9UL12	918 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ATRX	P46100	2492 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	USP27X	A6NNY8	438 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ATP9B	O43861	1147 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	RTN2	O75298	545 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CNTN5	O94779	1100 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PRKCI	P41743	596 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	BPIFB4	P59827	614 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PPP2CB	P62714	309 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PPP2CA	P67775	309 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	NPY6R	Q99463	290 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CHP1	Q99653	195 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	STK33	Q9BYT3	514 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MUC3B	Q9H195	1237 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	WDCP	Q9H6R7	721 aa		15.95	■□□□□ 0.14

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