RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ALG9Q9H6U8 611 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 EURLQ9NYK6 297 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ANAPC2Q9UJX6 822 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ASTN1O14525 1302 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 UXS1Q8NBZ7 420 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 UNC5CO95185 931 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ADRB2P07550 413 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TYMPP19971 482 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CHKAP35790 457 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 OAZ1P54368 228 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD2Q8IY47 623 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 OPTCQ9UBM4 332 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 VMP1Q96GC9 406 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 IL22Q9GZX6 179 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PLGRKTQ9HBL7 147 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL1Q9NR64 748 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 MYL12BO14950 172 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 PCID2Q5JVF3 399 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0A0MRY4 1105 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ANXA6P08133 673 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 NR1D2Q14995 579 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TAB1Q15750 504 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SYT12Q8IV01 421 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA13Q96N96 652 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 TAF5Q15542 800 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF544Q6NX49 715 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 MBOAT7Q96N66 472 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 IDH3BO43837 385 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 NFICP08651 508 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 MREGQ8N565 214 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 PORCNQ9H237 461 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SH3BGRLO75368 114 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ACOX1Q15067 660 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ZMPSTE24O75844 475 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 CXCL9Q07325 125 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PANX3Q96QZ0 392 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 DKK3Q9UBP4 350 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 A8MX80 341 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 EPN2O95208 641 aa21.62■■□□□ 1.05
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