RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KRT34	O76011	436 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	LRIG2	O94898	1065 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GLDC	P23378	1020 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GMPR	P36959	345 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CSRP3	P50461	194 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DLG2	Q15700	870 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TASP1	Q9H6P5	420 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	POMP	Q9Y244	141 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559		E9PBE3	544 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CACNG3	O60359	315 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL41	O60662	606 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM24	O75264	130 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TH	P07101	528 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MTTP	P55157	894 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PRKAA1	Q13131	559 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A1	Q13621	1099 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CCNI	Q14094	377 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DPF3	Q92784	378 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TSC22D3	Q99576	134 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	HHLA1	C9JL84	531 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB14	O43829	449 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA9	O76027	345 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DDHD2	O94830	711 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	AMH	P03971	560 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MYL3	P08590	195 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TPH1	P17752	444 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	NMBR	P28336	390 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ERF	P50548	548 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GRM3	Q14832	879 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PCID2	Q5JVF3	399 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINI1	Q99574	410 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	APOL2	Q9BQE5	337 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	NUP205	Q92621	2012 aa		18.72	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PDE5A	O76074	875 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	FES	P07332	822 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CCNC	P24863	283 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PEX19	P40855	299 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ACAD11	Q709F0	780 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SCML4	Q8N228	414 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	EDEM1	Q92611	657 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RNF34	Q969K3	372 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	IFT43	Q96FT9	208 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	APBA2	Q99767	749 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559		M0QZ92	97 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	AHCYL1	O43865	530 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	LYN	P07948	512 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	HTR7	P34969	479 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GRIA4	P48058	902 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf89	Q6UX73	402 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PDSS2	Q86YH6	399 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559		Q9Y3F1	56 aa		18.71	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC8	P31273	242 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ABCG1	P45844	678 aa		18.7	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms