RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 NENFQ9UMX5 172 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 PLXNA2O75051 1894 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 NUMA1Q14980 2115 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 A0A1B0GTW7 788 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 SLC12A8A0AV02 714 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 E7ENQ6 273 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 F8VZ95 297 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 H0Y626 953 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 MYO1FO00160 1098 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CETN3O15182 167 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 NDUFS2O75306 463 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TRIM16O95361 564 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ZBED1O96006 694 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 SYPP08247 313 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FAM153BP0C7A2 387 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 RALAP11233 206 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FERP16591 822 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ATP5DP30049 168 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ECHS1P30084 290 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CXCR5P32302 372 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 GTF2H1P32780 548 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ACSL1P33121 698 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CHKAP35790 457 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TKTL1P51854 596 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ZNF132P52740 706 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 COG7P83436 770 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ADCY2Q08462 1091 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 SCAPQ12770 1279 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 KCNMA1Q12791 1236 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TCEAL1Q15170 157 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 HLA-BQ31612 363 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FAM153CQ494X1 144 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ODF2Q5BJF6 829 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 KCTD16Q68DU8 428 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 KRT39Q6A163 491 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 PROSER1Q86XN7 944 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CACUL1Q86Y37 369 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ZNF366Q8N895 744 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TFAP2BQ92481 460 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CCT6BQ92526 530 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FOXJ1Q92949 421 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 MYO19Q96H55 970 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FAM117AQ9C073 453 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 CARD9Q9H257 536 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 GANQ9H2C0 597 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 MTG2Q9H4K7 406 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 RAB20Q9NX57 234 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-212ENST00000559276 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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