RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 OMDQ99983 421 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 DYRK4Q9NR20 520 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MCF2LO15068 1137 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 DCLK1O15075 740 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 KDELR3O43731 214 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MTA2O94776 668 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 LCA5LO95447 670 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PRNPP04156 253 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GNSP15586 552 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MPLP40238 635 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEA1P43355 309 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CREB5Q02930 508 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RAD51Q06609 339 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PDK2Q15119 407 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TCEAL1Q15170 157 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 OR7D4Q8NG98 312 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FRS2Q8WU20 508 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 HSPH1Q92598 858 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRN2Q92932 1015 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM7Q9C029 511 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NEU3Q9UQ49 428 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC72A6NJI9 287 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MEI4A8MW99 385 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC7A4O43246 635 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NRDCO43847 1150 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SNAP91O60641 907 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 IL1BP01584 269 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF806P0C7X5 589 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 BCKDHBP21953 392 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GSDMDP57764 484 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SYT12Q8IV01 421 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TMIEQ8NEW7 156 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PEBP4Q96S96 227 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 INVSQ9Y283 1065 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF292O60281 2723 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RASA4BC9J798 803 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RASA4O43374 803 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 BUB1O43683 1085 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GSRP00390 522 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RARAP10276 462 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GOT1P17174 413 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC8A1P32418 973 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PSMD8P48556 350 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF33AQ06730 810 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GRM3Q14832 879 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 Q6ZVU0 165 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 STK40Q8N2I9 435 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZMPSTE24O75844 475 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NDUFA10O95299 355 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SEMA4FO95754 770 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ERCC2P18074 760 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FECHP22830 423 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NUDT1P36639 197 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CDH6P55285 790 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ARF5P84085 180 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms