RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SNPHO15079 494 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 IFNB1P01574 187 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCP4P48539 62 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TPI1P60174 286 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SKP1P63208 163 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP8P85298 464 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CHAF1BQ13112 559 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NCF4Q15080 339 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC51AQ86UW1 340 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CHSY1Q86X52 802 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC8Q8TC99 324 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NDST4Q9H3R1 872 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 H0YGN5 161 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 M0QYT0 321 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GMFGO60234 142 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 WDR47O94967 919 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 INMTO95050 263 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TTC4O95801 387 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TAC1P20366 129 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLRK1P26718 216 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SPATS1Q496A3 300 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LBX2Q6XYB7 198 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CENPUQ71F23 418 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC18Q9H819 358 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF225Q9UK10 706 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLUHO75153 1309 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC37A3O60309 1634 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA12AO43301 675 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RGS10O43665 173 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MICAL2O94851 1124 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 COL9A1P20849 921 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RAP1GAPP47736 663 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CHN2P52757 468 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CASP7P55210 303 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PHKG1Q16816 387 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RETSATQ6NUM9 610 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SSX9Q7RTT3 188 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TTC7BQ86TV6 843 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 WDR49Q8IV35 697 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 P3H2Q8IVL5 708 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PEX13Q92968 403 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 VAV3Q9UKW4 847 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CYB561D2O14569 222 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ATG13O75143 517 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ULK1O75385 1050 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CAPZA1P52907 286 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 DPP10Q8N608 796 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF527Q8NB42 609 aa6.4□□□□□ -1.39
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