RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	C5AR1	P21730	350 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CASP14	P31944	242 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	MAPKAPK2	P49137	400 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GALC	P54803	685 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	BNC1	Q01954	994 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CA9	Q16790	459 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	EFHC2	Q5JST6	749 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	BIRC7	Q96CA5	298 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996		A0A087X0T9	212 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	MCF2L	O15068	1137 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	BNIP3L	O60238	219 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FAM228B	P0C875	321 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GOT1	P17174	413 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CHST14	Q8NCH0	376 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SNX19	Q92543	992 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	IQCD	Q96DY2	449 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	OMD	Q99983	421 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FZD4	Q9ULV1	537 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NENF	Q9UMX5	172 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GTW7	788 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP33	O14559	1287 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FSBP	O95073	299 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	EPHB2	P29323	1055 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CLCN6	P51797	869 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ADPRH	P54922	357 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GRIK2	Q13002	908 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PPM1J	Q5JR12	505 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	EBF2	Q9HAK2	575 aa		21.33	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ALOX15B	O15296	676 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CREB3	O43889	395 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	MYBL1	P10243	752 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	GNS	P15586	552 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	AIF1	P55008	147 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	AGBL4	Q5VU57	503 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KLC2	Q9H0B6	622 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	THAP2	Q9H0W7	228 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		21.32	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	RAMP2	O60895	175 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	LRCH4	O75427	683 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TCF4	P15884	667 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	MIP	P30301	263 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CHRNA3	P32297	505 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	FOXK2	Q01167	660 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CNTN1	Q12860	1018 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	LAYN	Q6UX15	382 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	VOPP1	Q96AW1	172 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TRIM11	Q96F44	468 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	EPAS1	Q99814	870 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	MAGEH1	Q9H213	219 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	21.31	■■□□□ 1	6e-6	■□□□□ 9.1
CS-222	ENST00000550996	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		21.31	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		21.3	■■□□□ 1
CS-222	ENST00000550996	WASH4P	A8MWX3	477 aa		21.3	■■□□□ 1

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