RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 WBP2Q969T9 261 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TADA1Q96BN2 335 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 IL22Q9GZX6 179 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 EPN3Q9H201 632 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TRABDQ9H4I3 376 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SP110Q9HB58 689 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 VPS45Q9NRW7 570 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 A0A1B0GVM2 712 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TMEM120BA0PK00 339 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 GMNCA6NCL1 334 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 HIDE1A8MVS5 230 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 KDELR3O43731 214 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 NEBLO76041 1014 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 USP1O94782 785 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 INHBAP08476 426 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CREB1P16220 341 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SYN1P17600 705 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 DNAJB1P25685 340 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ACVRL1P37023 503 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SERPINB9P50453 376 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CLCN4P51793 760 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 EPHA5P54756 1037 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 MPP2Q14168 576 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PCID2Q5JVF3 399 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TXNDC8Q6A555 127 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 KDELC1Q6UW63 502 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 RANBP10Q6VN20 620 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PPM1NQ8N819 430 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CDKL2Q92772 493 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SAMD11Q96NU1 681 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SMC6Q96SB8 1091 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 KIFC1Q9BW19 673 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PDFQ9HBH1 243 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TLR9Q9NR96 1032 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SYBUQ9NX95 663 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 A0A1W2PPM1 405 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 USP12O75317 370 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 KRT37O76014 449 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 MT-ND3P03897 115 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 POU2F2P09086 479 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 PTPN2P17706 415 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CES1P23141 567 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 43.3
CS-209ENST00000547449 CNTFP26441 200 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 HOXA9P31269 272 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 ETFBP38117 255 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SLC18A2Q05940 514 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 MGAT5Q09328 741 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 DNAJC3Q13217 504 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CAMK1Q14012 370 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 CRYMQ14894 314 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-209ENST00000547449 SLC14A2Q15849 920 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms