RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	PON2	Q15165	354 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R7	Q15435	360 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CYP1B1	Q16678	543 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	GEN1	Q17RS7	908 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	MARC1	Q5VT66	337 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ATL2	Q8NHH9	583 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	FAM3C	Q92520	227 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CHFR	Q96EP1	664 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY11	Q96G91	374 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SHD	Q96IW2	340 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF599	Q96NL3	588 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	TSGA13	Q96PP4	275 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	KRT12	Q99456	494 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	VAT1	Q99536	393 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658		J3KR12	359 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM24	O15164	1050 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CCNB1	P14635	433 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	DRD1	P21728	446 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	GLDC	P23378	1020 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	MMP13	P45452	471 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	GALK1	P51570	392 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CLCN6	P51797	869 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	RHOA	P61586	193 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	DR1	Q01658	176 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ITK	Q08881	620 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	C8orf74	Q6P047	294 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ALG14	Q96F25	216 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	LMLN	Q96KR4	655 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	WNT16	Q9UBV4	365 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SEPT3	Q9UH03	358 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	KCNK1	O00180	336 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	RNF103	O00237	685 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	STK25	O00506	426 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	VAV1	P15498	845 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF4	P43489	277 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	KCNJ1	P48048	391 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SEC13	P55735	322 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ARF5	P84085	180 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	P3H1	Q32P28	736 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO43	Q4G163	708 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	SDE2	Q6IQ49	451 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	ALLC	Q8N6M5	410 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	FATE1	Q969F0	183 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	TTC17	Q96AE7	1141 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC45	Q96CN5	670 aa		12.11	□□□□□ -0.47

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