RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CSNK2BP67870 215 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DUPD1Q68J44 220 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA33Q96N06 139 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LHX5Q9H2C1 402 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 FZD8Q9H461 694 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 KRT84Q9NSB2 600 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC42Q9Y546 428 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GRIN2DO15399 1336 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MYO1DO94832 1006 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 UQCRBP14927 111 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ITGALP20701 1170 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GRIK1P39086 918 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRD-214ENST00000540109 ERVK-9P63128 1117 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DMC1Q14565 340 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CHI3L2Q15782 390 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PHC2Q8IXK0 858 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 UBR7Q8N806 425 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SMYD1Q8NB12 490 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRD-214ENST00000540109 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CGREF1Q99674 301 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ELP3Q9H9T3 547 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TMCC2O75069 709 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SEMA4DQ92854 862 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GLS2Q9UI32 602 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 FCHO1O14526 889 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ERAP2Q6P179 960 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 MON1BQ7L1V2 547 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 AHI1Q8N157 1196 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BBS5Q8N3I7 341 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PPTC7Q8NI37 304 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CDH19Q9H159 772 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GRIN3BO60391 1043 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CNMDO75829 334 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 EPHX2P34913 555 aa6.14□□□□□ -1.43
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