RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531524.5

BSCL2-223, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, human

TSL 3

Gene BSCL2, Length 844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BSCL2-223	ENST00000531524	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524		F5H5T6	163 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524		I6L893	689 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	EFS	O43281	561 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	AP1G1	O43747	822 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	USP12	O75317	370 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CLDN11	O75508	207 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TCEA3	O75764	348 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ZMPSTE24	O75844	475 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	WISP1	O95388	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	MT-CO1	P00395	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CALCA	P01258	141 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	APOE	P02649	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CSF2	P04141	144 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	GLI1	P08151	1106 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC2A3	P11169	496 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	SRC	P12931	536 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	PRLR	P16471	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ITGB6	P18564	788 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TGM2	P21980	687 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CHRNA3	P32297	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NNMT	P40261	264 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ACADSB	P45954	432 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CSRP3	P50461	194 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CLCN6	P51797	869 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	LRRC63	Q05C16	580 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CLN3	Q13286	438 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	MTA1	Q13330	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TAF5	Q15542	800 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	XKR5	Q6UX68	686 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524		Q6ZVU0	165 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CHSY1	Q86X52	802 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NT5C3B	Q969T7	300 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ARRDC3	Q96B67	414 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	BOC	Q9BWV1	1114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	MIS12	Q9H081	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	THSD1	Q9NS62	852 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	KLF15	Q9UIH9	416 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	POM121B	A6NF01	834 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NEMP2	A6NFY4	417 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524		E5RJQ4	531 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	LMO7DN	F2Z398	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524		K7ERQ8	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	PIK3R2	O00459	728 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	RAD51B	O15315	384 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC31A1	O15431	190 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	FFAR2	O15552	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	KLK10	O43240	276 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	SPINT1	O43278	529 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BSCL2-223	ENST00000531524	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms